SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技術是利用哺乳動物細胞增殖對必需氨基酸的依賴性原理而設計的代謝標記蛋白質的方法。SILAC技術應用于定量蛋白質組研究,為全面、系統地定性和定量分析復雜哺乳動物細胞蛋白質組提供了有效的方案,是目前較先進的、進行細胞中蛋白質相互作用和蛋白質表達差異的定量蛋白質組學技術。
體內標記技術,標記效率高;
活體標記,更接近樣品真實狀態;
定量精確,線性范圍廣,定量重復性好;
與化學標記相比,樣本量要求少;
可在對多種培養基中的多種細胞進行標記。
藥物作用靶點研究;
疾病標志物篩選;
只適用于活體培養的細胞,對于生物醫學研究中常用的組織樣品,體液樣品等無法分析,對于動物模型的標記成本太大,無法實現;
要求物種含有已完成全基因組測序或轉錄組測序注釋的CDS信息。
需鑒定的樣品;
樣品信息單:需詳細填寫樣品來源、含量、狀態及其他基本信息。
實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析)。
生物信息學分析內容包括:
SILAC定性分析:包括肽段、蛋白鑒定結果統計、重復性分析、unique肽段數分布、肽段長度分布、蛋白覆蓋度分布;
SILAC定量分析:包括肽段、蛋白定通量統計、差異蛋白篩選、蛋白豐度比值分布、差異蛋白表達量層次聚類分析;
蛋白質功能注釋分析:包括GO分類;COG注釋;Pathway通路分析;
差異蛋白功能富集:包括對差異蛋白GO富集分析;差異蛋白Pathway通路分析;
差異蛋白網絡互作分析;
蛋白質結構域預測。
自送樣起45個工作日。
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