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長鏈非編碼RNA(lncRNA)研究

服務簡介

長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)指的是長度超過200nt的RNA分子。它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構,可與蛋白質、DNA和RNA相互作用,通過多種機制(如基因印記、染色質重塑、細胞周期調控、剪接調控、mRNA降解和翻譯調控等)在多種層面上(如表觀遺傳學、轉錄調控及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。

lncRNA參與多種生物學過程的調控,在多種生命活動中發揮重要作用,該領域的關注度也日益增高,已成為繼信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNA、siRNA等)之后功能基因組學最火熱的研究領域。

服務內容

金開瑞現提供下述lncRNA研究服務:

1、確定lncRNA表達

利用q-PCR技術檢測lncRNA在不同組織中的表達水平。

2、探究lncRNA特點

(1)通過QD-FISH原位雜交技術定位;或者通過細胞核質分離試劑盒得到RNA,qRT-PCR檢測其分布;

(2)全長序列試驗方法:通過RACE得到lncRNA完整的全長序列。

3、lncRNA的功能研究

lncRNA較長,承載的信息量多,更容易形成高級結構,其功能具有多樣化和特異性強的特點。類似于miRNA,探討lncRNA功能可用 gain/loss of function 策略,過表達或沉默lncRNA后觀察表型。即研究lncRNA功能獲得后或者功能缺失后對細胞增殖、凋亡、侵襲、轉移與克隆形成,以及病毒的轉錄復制等的影響。

(1)功能獲得性研究

構建lncRNA過表達質粒或者慢病毒、腺病毒包裝載體。

(2)功能缺失性研究

siRNA、shRNA、CRISPR/cas9。

4、檢測結合蛋白質

利用體外轉錄,RNA pull down, MS等技術手段檢測與RNA綁定的蛋白質。

5、預測并驗證作用的miRNA

利用軟件預測miRNA在lncRNA的作用靶點,并進行驗證。

6、表達調控

將lncRNA表達與其他領域相結合,解釋其調控機理。(1)DNA甲基化和乙酰化:可通過檢測相應基因甲基化、乙酰化差異與lncRNA結合分析。(2)轉錄因子:研究lncRNA與轉錄因子的調控機制。

如何訂購

您可以發郵件至zonghe@genecreate.com,或點擊屏幕右側“在線咨詢”,或撥打咨詢電話027-62431110,我們會盡快安排工作人員與您聯系!

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