蛋白質組學（proteomics）是從整體的角度，分析細胞（或組織等）內動態變化的蛋白質組成成份、表達水平與修飾狀態，了解蛋白質之間的相互作用與聯系，揭示蛋白質功能與細胞生命活動規律的一門新的科學技術。

本講座從蛋白質組學基礎知識介紹、基于質譜技術的蛋白質組學原理、蛋白質組學主要定性&定量技術介紹三個方面展開，讓大家了解什么是蛋白質組學、蛋白質組學技術的發展，和目前主流的蛋白質組學技術及應用。

翻譯后修飾（Post-translational modifications，PTMs） 是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程，在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團，可以改變蛋白質的理化性質，進而影響蛋白質的空間構像、活性狀態、亞細胞定位、折疊及其穩定性以及蛋白互作。修飾蛋白質組可以對蛋白質修飾位點進行鑒定、定量和功能分析，具有高通量、更精確、更全面、更新穎等優勢

本講座從PTM的背景介紹和應用，PTM研究方法等兩個方面展開，對磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化及其他常見修飾蛋白質組進行了詳細介紹。

亞細胞蛋白質組學(subcellular proteomics)是針對細胞內不同區域結構功能單位的蛋白質組學研究。

基于石蠟包埋樣本（FFPE）的蛋白質組學研究，在疾病機理研究、生物標志物發現，尤其是罕見病的研究中具有十分重要的意義。

本講座內容包含亞細胞器蛋白質組學的介紹、意義、技術支撐和應用，以及FFPE蛋白質組學研究意義、難點和技術應用。

樣本上機前，需要經過一個樣本前處理的過程，以達到減少人為降解和修飾，釋放盡可能多的肽段的目的。

本講座對樣本前處理過程進行了詳細的講解，包括常規樣品的蛋白提取，還原、烷基化、質控，酶解、除鹽、標記，肽段分級，翻譯后修飾樣本處理，樣本量、取樣和運輸保存。

利用蛋白質組學可以揭示生命活動的基本規律，同時也為臨床診斷、藥物篩選、新藥開發和個性化醫療等諸多領域提供理論依據。

本講座從蛋白質組學技術簡介出發，對質譜數據解析原理及方法、蛋白質組定量及評估、蛋白質組定量方法比較及選擇等進行了詳細介紹。

蛋白質組學技術的主要目的是為了找到一些具有特定功能、或調控特定通路的重要蛋白。當我們通過基本的定量蛋白質組學發現了成千上萬個蛋白，發現了上百個表達量顯著差異的蛋白后，我們就需要進一步對這些蛋白進行功能分析。

本講座詳細介紹了蛋白質組學的基礎功能分析相關內容，包括Gene Ontology Database，COG Analysis，KEGG Pathway Analysis 和Functional Enrichment。